Sök på hela webbplatsen

Akut / dygnet runt - Nedre luftvägspanel, SkaS Skövde / Lidköping

Indikation

Misstanke om nedre luftvägsinfektion.

Denna panel är främst avsedd för användning vid utvidgad diagnostik av svåra pneumonier. Bakterier (även atypiska), virus och resistensgener detekteras samtidigt. Panelen ska endast användas för analys av sputum/BAL/trakealsekret från patienter med svår samhällsförvärvad eller sjukhusförvärvad pneumoni.

OBS! Det ”nya coronaviruset” som orsakar COVID-19 (dvs SARS-CoV-2) påvisas INTE med denna metod.

 

Påvisning av virus med molekylärbiologiska metoder (PCR) är begränsat till sjukdomens första 1-2 veckor.

 

Den nedre luftvägspanelen ska ses som ett screeningprov och ersätter inte sedvanlig rutindiagnostik. Laboratoriet kommer automatiskt att lägga till en vanlig odling av samma prov.

Ett negativt resultat utesluter inte infektion med ingående agens. Vid klinisk misstanke om atypisk bakterie, influensa eller RSV och ett negativt resultat bör riktad analys från optimal provtagningslokal utföras.

Tänk på att Bordetella pertussis/B. parapertussis, Francisella tularensis och Chlamydia psittaci inte ingår i panelen.

 

 

 

 

Analysmetod

Multiplex realtids-PCR (DNA/RNA) på FilmArray, för mer information klicka här.

Metoden påvisar totalt 18 bakterier, 10 luftvägsvirus och 7 resistensmarkörer (se lista nedan). Detektionen är semi-kvantitativ för bakterier och kvalitativ för atypiska bakterier och virus.

OBS! Det ”nya coronaviruset” som orsakar COVID-19 (dvs SARS-CoV-2) påvisas INTE med denna metod.

Enterovirus påvisas med denna metod, men kan inte särskiljas från Rhinovirus. För mer information om allvarlig luftvägssjukdom orsakat av enterovirus D68 se Folkhälsomyndighetens hemsida.        

De ingående analyserna utförs endast tillsammans.

I luftvägspanelen ingår analys av nedanstående agens:

Virus (kvalitativ):

Adenovirus 
Humant metapneumovirus hMPV
Coronavirus 
Influensa A 
Influensa B 
RSV 
Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV)
Parainfluensavirus
Rhinovirus/Enterovirus

Atypiska bakterier (kvalitativ):
Mycoplasma pneumoniae
Chlamydophila pneumoniae
Legionella pneumophila

Bakterier (semi-kvantitativ): 

Acinetobacter calcoaceticus-baumannii complex

Enterobacter cloacae

Eshcerichia coli

Haemophilus influenzae

Klebsiella aerogenes

Klebsiella oxytoca

Klebsiella pneumoniae group

Moraxella catarrhalis

Proteus spp.

Pseudomonas aeruginosa

Serratia marcescens

Staphylococcus aureus

Streptococcus agalactiae (streptokocker grupp B)

Streptococcus pneumoniae

Streptococcus pyogenes (streptokocker grupp A)

Resistensgener (endast vid samtidig påvisning av relevant bakterie):

Methicillinresistens (mecA/mecC och MREJ)

ESBL-CARBA (IMP, KPC, NDM, Oxa-48 like, VIM)

ESBL (CTX-M)

Remiss

SkaS Skövde/Lidköping: 
Elektronisk remiss i Melior. Ange kliniska data i anamnesruta. Följande uppgifter önskas:

Aktuell diagnos, orsak till provtagning, avslutad och pågående antibiotika.

Analysen utförs på laboratoriet i Skövde men kan beställas av alla inom SkaS med tillgång till Melior.

 

 

Provtagning
Provtyp Provtagningsmateriel Provtagning
Sputum Sputumburk/rör med ytterförpackning.
Provtagning bör helst utföras på morgonen, gärna med hjälp av sjukgymnast. Låt patienten skölja munnen med vatten före provtagning.
Instruera patienten att hosta upp sekret från nedre luftvägarna.
Trakealsekret Bronksekret  Sterilt plaströr med skruvlock. Prov tas med sugkateter, trakealsugset eller bronkoskop.
BAL-prov
Bronksköljvätska mini-BAL
 Sterilt plaströr med skruvlock. Sköljning görs i regel med steril fysiologisk koksalt (NaCl).Tag 5-10 mL av sköljvätskan till ett sterilt plaströr med skruvlock.

 

Förvaring/transport

Förvaring: i kyl i väntan på transport.

SkaS Skövde/Lidköping: Akutmärk provet med akutetikett.

När dessa prover lämnas till laboratoriet i Skövde skall de alltid lämnas in vid laboratoriets provinlämningslucka och personalen ska kontaktas. Då luckan är stängd, använd kontaktrutiner för respektive ort (se info vid lucka) för att få kontakt med laboratoriets personal.

Om prov skickas från andra sjukhus än Skövde, kontakta laboratoriets personal för att förvarna om att ett prov är på väg. Detta gäller både vid ordinarie transport och akut transport.

Obs! Lämnas dessa prover på fel ställe eller utan att meddela personal kan det innebära stora fördröjningar av provsvaren.

OBS! Vid fel provtagningsmateriel eller fel remiss kan analys inte utföras.

Svarsrutiner

Analysfrekvens: dygnet runt, alla dagar.

Svarstid: Elektroniskt svar på luftvägspanelen lämnas inom ca 2 h. Svar på samtidig odling tidigast efter 2 dygn.

Svarstext:

För nedre luftvägspanelen är svarstexten PÅVISAD /ej påvisad för respektive agens som ingår i panelen.

Upplysningar om eventuell anmälningsplikt enligt smittskyddslagen kommenteras i förekommande fall.

 

Bakterier som semikvantifieras besvaras med mängd utifrån fyra olika nivåer från 10 000 kopior/mL och anges i svaret som 10^4-10^7 kopior/mL.

Påvisad bakterie med angiven mängd besvaras med kommentaren: " Resultatet bör tolkas i samråd med infektionskonsult. Kompletterande odlingssvar följer."

Samtidig odling svaras med kommentaren: "Nedre luftvägspanel har utförts på detta prov. Var god se RID ... i melior. Vid svårtolkade resultat konsultera infektionsläkare".

 

Vid påvisad resistensgen svaras för MRSA " Utredning för MRSA pågår. fyndet bör hanteras som MRSA men är inte anmälningspliktigt i nuläget. Kompletterande svar följer" och för ESBL " Utredning för ESBL pågår, kompletterande svar följer".

- Om MRSA odlas fram kommer odlingen svaras ut enligt sedvanlig rutin.

- Om MRSA ej kan odlas fram svaras " PCR påvisad MRSA ej framodlad" och kommentaren

”MRSA påvisat i nedre luftvägspanel har ej kunnat odlas fram. Bör betraktas som MRSA men är ej anmälningspliktigt. MRSA-screening rekommenderas. Var god informera infektionsläkare för vidare handläggning.”

- Om ESBL odlas fram kommer odlingen svaras ut enligt sedvanlig rutin.

- Om ESBL ej odlas fram svaras "Misstänkt ESBL i PCR ej framodlad" och kommentaren

”ESBL har inte kunnat odlas fram. ESBL-screening kan övervägas”.

 

Tolkning av svar

Resultatet ska tolkas utifrån klinisk bild och övriga diagnostiska tester. Ett negativt resultat utesluter inte infektion med ingående agens.

Resultatet bör tolkas i samråd med infektionskonsult.

Resultatet av semikvantifieringen ska bedömas utifrån vilken provtagningsteknik som använts. Dessa bakterier (de som kvantifieras) kan förekomma som kolonisationsflora i orofarynx och orsaka provtagningsförorening. Ett högre bakterietal krävs i sputum, trachealsekret och bronksekret än i mini-BAL och BAL för att ett fynd ska anses vara signifikant.

Resistensgener för ESBL blir endast påvisade om en relevant bakterie påvisats i provet. Men det betyder inte att den påvisade bakterien bär genen. I dessa fall odlas provet för att utreda misstanken.

Vid påvisad MRSA har såväl mecA/mecC, MREJ (St.aureus specifk gensekvens av resistensgenen) samt Staphylococcus aureus påvisats. Vidare utredning med odling utförs för att konfirmera fyndet.

Kontakt

Camilla Kiszakiewicz, ST-läkare Klinisk mikrobiologi

Skribent: Camilla Kiszakiewicz, ST-läkare Klinisk mikrobiologi, Laboratoriemedicin Unilabs Redaktör: Anna-Karin Brodin, Leg. Biomedicinsk analytiker, Laboratoriemedicin Unilabs

Uppdaterad: 2020-02-05

Anvisningen genomgår regelbunden revision, senast 0001-01-01

Synpunkter på innehållet?  Tyck till
Sökresultat
Stäng