Kraftigt förhöjda värden ses vid en rad olika skelettsjukdomar som osteitis deformans, rakit och metastaser. Hyperparatyreoidism kan ge klart förhöjda värden medan mindre stegringar ses vid osteomalaci och frakturläkning.
Gallvägsobstruktion kan ge mycket höga värden och stegringar ses vid många andra leveråkommor.
I slutet av graviditeten stiger ALP.
Kroniskt förhöjda värden kan bero på så kallad makroenzymemi (komplex mellan ALP och immunglobuliner) eller på familjär hyperfosfatasemi.
Spädbarn kan uppvisa mycket kraftiga ALP-stegringar vid tillståndet övergående godartad hyperfosfatasemi.
Låga värden skall i första hand föra tanken till det ovanlig ärftliga tillståndet hypofosfatasi. Bland analytiska felkällor finns bland annat EDTA som stör analysen.
Vid oklarhet om orsak till en ALP-stegring kan Alkaliska fosfataser isoenzymer ofta vara vägledande. Var god se S-ALP isoenzymer (alkaliska fosfataser).