Vävnadsbitar (biopsier), odling

Påvisande av bakterier och svamp i biopsier från ben och mjukdelar samt i icke kroppseget material från sterila lokaler.

Vävnadsodlingar tas också vid misstanke om protesinfektioner, eller som rutinodling i samband med protesoperationer. Bakterier som påvisas är ofta koagulasnegativa stafylokocker (KNS), Corynebacterium spp, Cutibacterium spp., Bacillus spp. och alfastreptokocker. S.aureus, beta-streptokocker och gramnegativa Enterobacterales spp kan också förekomma.

Vävnadsodling kan även tas inför bendonation.

Bakterieodling efter anrikning i buljong.

Odlingstider:

Rutinodling: 10 - 14 dagar

Förlängdodling görs på misstanke om protesinfektion, särskild information på remissen samt enligt önskemål från provtagaren.   

Elektronisk remiss/beställning eller

pappersremissen Laboratorieremiss 2.

Sterila vävnadsbitar (dvs ej haft kontakt med hud eller slemhinna):

Vävnadsbiten läggs ned i steril burk/rör med anrikningsbuljong som rekvireras från laboratoriet, alternativt kan små vävnadsbitar och biopsier stoppas i sterilt rör utan tillsats, t.ex sterila urinrör. För att förhindra uttorkning av provmaterialet kan 0.5 - 1.0 mL steril koksaltlösning tillsättas.

Icke-sterila vävnadsbitar (t.ex. nekrotiska sår, diabetesfotsår, m.m.):

Vävnadsbitar från icke-sterila lokaler läggs ned i sterilt rör utan tillsats enligt ovan, inte i burk med buljong. Vid odling av dessa prover finns risk för överväxt av hudflora när provet inkuberas i anrikningsbuljong vilket kan försvåra tolkningen av resultatet. Därför utförs en primärodling först på labbet innan provet inkuberas i anrikningsbuljong.

Mykobakterier
se anvisning Mykobakterier (Tuberkulos, TBC) odling/mikroskopi/PCR.

Rör med buljong kan förvaras och skickas i rumstemperatur. Sterila rör utan tillsats bör kylförvaras i väntan på transport. Prov bör anlända labbet samma dag som provtagning.

Preliminärsvar skickas ut efter typning (undantag är vid klar misstanke om kontamination), efter resistensbestämning och efter tillkomst av nya fynd.

Svarstid:

- Positiva slutsvar med typning och resistensbestämning vanligen inom 6-10 dygn.

- Negativa svar mellan 10-14 dygn.

Vid misstanke om svårodlade bakterier eller om patienten fått antibiotikabehandling innan provtagning kan en eller flera biopsibitar tas för 16S rRNA PCR. Provet skickas vidare till extern labb. Provet kan skickas i sterilt rör av glas eller polypropylen utan tillsats.