Gastroenteritpanel, multiplex DNA/RNA

Gastroenterit. Utbrottsutredning och smittspårning.

Bakterier, virus och parasiter kan orsaka gastroenterit, infektiös diarré. Infektiösa agens kan vara svåra att skilja kliniskt från varandra.

Denna panel påvisar 11 olika bakterier, 4 parasiter och 5 olika virus på ett och samma prov med molekylärbiologisk multiplex metod. 

Klicka på Läs mer så kan du se vilka 20 agens som ingår i gastroenteritpanelen.

Gastroenteritpanelen/Multiplex realtids-PCR (DNA/RNA) på FilmArray följt av selektiv odling, för mer information klicka här.

PCR är oftast positivt kort efter insjuknandet, men därefter mer osäkert.

Odling utförs endast på prover där specifika agens påvisats med PCR.

Sörmland: Analyser beställs via Klinisk kemis elektroniska beställningskatalog.

Västra Götaland: beställs på pappersremissen Laboratorieremiss 2.

OBS! Inom Västra Götaland får beställas endast efter kontakt med Smittskydd eller Vårdhygien.

Ange aktuellt telefonnummer för telefonsvar.

Ange datum för symtomdebut, smittland och ev. information om utbrott.

Avföringsprov, feces

Provtagningsrör med sked, för feces (utan tillsats), se bild och hantering.
2-3 skedar feces (lös avföring) överföras till ett provtagningsrör med sked för feces (utan tillsats).

Skruva på locket ordentligt.

Märk röret med streckkodsetikett från den mikrobiologiska remissen. Det är mycket viktigt att provtyp anges tydligt!

Alternativt pinnprov Provtagningsset, universellt eSwab (rosa eller vit kork)

Märk röret med streckkodsetikett från den mikrobiologiska remissen. Det är mycket viktigt att provtyp och analys anges tydligt! Endast flockad pinne som ingår i setet får användas vid provtagning.

Doppa och rotera pinnen i lös avföring, ej fast feces. Ta ej mer än vad pinnen får med upp.
Efter provtagning, för över pinnen till röret med transportmedium.
Bryt av pinnen vid markeringen, mot kanten av röret. Skruva på locket ordentligt.

Förvaras i kyl i väntan på transport.

Ankomst till laboratoriet inom 24 timmar.

Skickas i rumstemperatur eller i kyla.

Analys utförs vardagar och helger (i Sörmland).

Svarstid:

Sörmland: inom 1 dygn

Västra Götland:1 - 2 dagar.

Svarstext:

Agens PÅVISAD / ej påvisad

Telefonsvar enligt lokala överenskommelser.

Sörmland: Svaret skickas elektroniskt

Västra Götland: Papperssvar till både beställare och Smittskydd/Vårdhygien.

Fynd av bakterierna Salmonella, Shigella, Campylobacter, Yersinia, Vibrio, EHEC och parasiterna Entamoeba histolytica, Giardia och Cryptosporidium är anmälningspliktiga enligt Smittskyddslagen.

Specifika analyskommentarer för tolkning av svar bifogas svarstexten för påvisade agens i denna panel.

Efterföljande selektiv odling utförs från samma fecesrör då anmälningspliktiga bakterier påvisats med molekylär metod.

Shigella/EIEC kan endast särskiljas efter odling.

Vid påvisad EHEC skickas provet externt för kompletterande undersökning/typning. Även vid fynd av Vibrio cholerae eller andra Vibrio kan kompletterande undersökningar vara aktuella.

Vid Salmonella och inhemsk smitta skickas den odlade stammen för vidare typning.

Ackrediteringen omfattar alla agens i panelen med undantag av Cyclospora, Plesiomonas och Vibrio.